Дар Муассисаи давлатии “Коллеҷи тиббии шаҳри Қӯрғонтеппа” мувофиқи Консепсияи ислоҳоти таҳсилоти тиббӣ ва фармасевтӣ 7 шӯъба амал мекунад :

1. Кори момодоягӣ (ихтисос-момодоя)
2. Кори умумитиббӣ (ихтисос-ҳамшираи (бародари)  тибби оилавӣ).
3. Кори ҳамширагӣ (ихтисос-ҳамшираи тиббӣ).
4. Кори лабораторӣ (ихисос – тахассуси мутахассис лаборант).
5. Кори фармасевтӣ (ихтисос-ёрдамчии фармасевт).
6. Кори беҳдоштӣ-вогиршиносӣ (ихтисос-ёрдамчии духтури санитарӣ ва эпидемиолог).
7. Кори дандонсозӣ (ихтисос-техники дандон).

 Аз моҳи сентябри соли 2013 дар коллеҷ шӯъбаи шабона ба фаъолият оғоз намуд, ки  аз рӯи ихтисосҳои кори ҳамширагӣ ва кори фарматсевтӣ донишҷӯён қабул карда шуд.